ڍانچي خاصيتون ۽ transmembrane peptides جي درجه بندي

Transmembrane peptides جا ڪيترائي قسم آھن، ۽ انھن جي درجه بندي فزيڪل ۽ ڪيميائي ملڪيتن، ذريعن، انجڻ جي ميڪانيزم، ۽ بايوميڊيڪل ايپليڪيشنن تي ٻڌل آھي.انهن جي جسماني ۽ ڪيميائي ملڪيتن جي مطابق، جھلي ۾ داخل ٿيندڙ پيپٽائڊس کي ٽن قسمن ۾ ورهائي سگھجي ٿو: ڪيشنڪ، امفيفيلڪ ۽ هائيڊروفوبڪ.Cationic ۽ amphiphilic membrane penetrating peptides جو حساب 85% آهي، جڏهن ته هائيڊروفوبڪ جھلي ۾ داخل ٿيندڙ پيپٽائيڊس جو حساب صرف 15% آهي.

1. Cationic membrane penetrating peptide

Cationic transmembrane peptides مختصر پيپٽائڊس تي مشتمل آھن جيڪي ارجنائن، لائسين ۽ ھسٽيڊائن ۾ مالا مال آھن، جھڙوڪ TAT، Penetratin، Polyarginine، P22N، DPV3 ۽ DPV6.انهن مان، ارجنائن ۾ گيانڊين شامل آهي، جيڪو سيل جھلي تي منفي چارج ٿيل فاسفورڪ ايسڊ گروپن سان هائڊروجن بانڊ ڪري سگهي ٿو ۽ جسماني پي ايڇ ويل جي حالت ۾ جھلي ۾ ٽرانسميبرن پيپٽائڊس کي وچولي ڪري ٿو.oligarginine جي مطالعي (3 R کان 12 R تائين) ڏيکاريو ويو آهي ته جھلي جي دخول جي صلاحيت صرف حاصل ڪئي وئي هئي جڏهن ارجنائن جي مقدار گهٽ ۾ گهٽ 8 هئي، ۽ جھلي جي دخول جي صلاحيت ارجنائن جي مقدار جي واڌ سان آهستي آهستي وڌي وئي.ليسين، جيتوڻيڪ ڪيشنڪ جهڙوڪ آرگنائن، گيانائيڊائن تي مشتمل ناهي، تنهنڪري جڏهن اهو اڪيلو موجود آهي، ان جي جھلي جي دخول ڪارڪردگي تمام گهڻي نه آهي.Futaki et al.(2001) ڏٺائين ته سٺو جھلي دخول اثر صرف حاصل ڪري سگهجي ٿو جڏهن cationic cell membrane penetrating peptide ۾ گهٽ ۾ گهٽ 8 مثبت چارج ٿيل امينو اسيد شامل آهن.جيتوڻيڪ مثبت طور تي چارج ٿيل امينو اسيد جا رهاڪو گھمڻ واري پيپٽائڊس لاءِ جھلي ۾ داخل ٿيڻ لاءِ ضروري آھن، ٻيا امينو اسيد به ساڳيا اھم آھن، جھڙوڪ جڏھن W14 F ۾ تبديل ٿي وڃي ٿو، ته Penetratin جي داخل ٿيڻ جي صلاحيت ختم ٿي وڃي ٿي.

cationic transmembrane peptides جو هڪ خاص طبقو نيوڪليئر لوڪلائيزيشن sequences (NLSs) آهي، جنهن ۾ ارجنائن، لائسين ۽ پرولين سان مالا مال مختصر پيپٽائڊس شامل آهن ۽ انهن کي نيوڪليئر پور ڪمپليڪس ذريعي نيوڪليس ڏانهن منتقل ڪري سگهجي ٿو.NLSs کي وڌيڪ ورهائي سگھجي ٿو سنگل ۽ ڊبل ٽائپنگ، جنهن ۾ ترتيب وار هڪ ۽ ٻه ڪلسٽر بنيادي امينو اسيدز شامل آهن.مثال طور، PKKKRKV سمين وائرس 40 (SV40) مان هڪ واحد ٽائپنگ اين ايل ايس آهي، جڏهن ته ايٽمي پروٽين هڪ ڊبل ٽائپنگ اين ايل ايس آهي.KRPAATKKAGQAKKKL ھڪڙو مختصر تسلسل آھي جيڪو جھلي transmembrane ۾ ڪردار ادا ڪري سگھي ٿو.ڇاڪاڻ ته اڪثر NLSs ۾ چارج نمبر 8 کان گهٽ هوندا آهن، NLSs اثرائتو ٽرانسميبرن پيپٽائيڊس نه هوندا آهن، پر اهي اثرائتو ٽرانسميبرن پيپٽائڊس ٿي سگهن ٿيون جڏهن هائيڊروفوبڪ پيپٽائڊ جي تسلسل سان جڙيل هجي ته جيئن ايمففيلڪ ٽرانسميبرن پيپٽائيڊس ٺاهن.

ساخت-2

2. Amphiphilic transmembrane peptide

Amphiphilic transmembrane peptides hydrophilic ۽ hydrophobic ڊومينز تي مشتمل آھن، جن کي ورهائي سگھجي ٿو پرائمري ايمفيفيلڪ، سيڪنڊري α-helical amphiphilic، β-folding amphiphilic ۽ prolin-enriched amphiphilic.

پرائمري قسم جي amphiphilic wear membrane peptides کي ٻن ڀاڱن ۾ ورهايو ويو آهي، ڪيٽيگري سان NLSs covalently hydrophobic peptide sequence سان ڳنڍيل آهن، جهڙوڪ MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) ۽ Pep - 1 (KETWWETWWTEWTEWTEWSQVKRK4KVK4KVK4KVK جي مقامي نشانين تي ٻڌل آهن). ، جنهن ۾ هائيڊروفوبڪ MPG جو ڊومين HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) جي فيوزن تسلسل سان لاڳاپيل آهي، ۽ Pep-1 جو هائيڊروفوبڪ ڊومين اعلي جھلي جي لاڳاپي (KETWWET WWTEW) سان ٽريپٽوفن رچ ڪلستر سان لاڳاپيل آهي.جڏهن ته، ٻنهي جا هائيڊروفوبڪ ڊومينز WSQP ذريعي ايٽمي لوڪلائيزيشن سگنل PKKKRKV سان ڳنڍيل آهن.پرائمري ايمفيفيلڪ ٽرانسميمبرن پيپٽائڊس جو ٻيو طبقو قدرتي پروٽينن کان الڳ ٿي ويو، جهڙوڪ pVEC، ARF (1-22) ۽ BPrPr (1-28).

ثانوي α-helical amphiphilic transmembrane peptides α-helices ذريعي جھلي سان جڙيل آهن، ۽ انهن جي هائيڊروفيلڪ ۽ هائيڊروفوبڪ امينو اسيد جي باقيات هيليڪل ساخت جي مختلف سطحن تي واقع آهن، جهڙوڪ MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).بيٽا پيپٽائيڊ فولڊنگ ٽائپ امفيفيلڪ وير ميمبرن لاءِ، ان جي بيٽا پيليٽيڊ شيٽ ٺاهڻ جي صلاحيت ان جي جھلي جي دخول جي صلاحيت لاءِ انتهائي اهم آهي، جيئن ته VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) جي دخول جي صلاحيت جي تحقيق جي عمل ۾، ڊي ميبرن جي قسم کي استعمال ڪندي. - امينو اسيد ميوٽيشن اينالاگس بيٽا فولڊ پيس ٺاهي نه سگهيا آهن، جھلي جي دخول جي صلاحيت تمام خراب آهي.پرولائن جي افزودگي واري ايمفيفيلڪ ٽرانسميمبرين پيپٽائڊس ۾، پوليپرولين II (PPII) آساني سان خالص پاڻي ۾ ٺھيل آھي جڏھن پرولين پوليپيپٽائڊ ڍانچي ۾ وڏي پئماني تي ٺھيل آھي.PPII هڪ کاٻي هٿ وارو هيلڪس آهي جنهن ۾ 3.0 امينو اسيد جي باقيات في موڙ سان آهي، جيئن معياري ساڄي هٿ واري الفا-هيلڪس ساخت جي مخالفت سان 3.6 امينو اسيد جي باقيات في موڙ سان.پرولائن اينريچڊ امفيفيلڪ ٽرانسميمبرن پيپٽائيڊس شامل آهن بوائن اينٽي مائڪروبيل پيپٽائيڊ 7 (Bac7)، مصنوعي پوليپيپٽائيڊ (PPR) n (n ٿي سگھي ٿو 3، 4، 5 ۽ 6) وغيره.

ساخت-3

3. Hydrophobic جھلي penetrating peptide

Hydrophobic transmembrane peptides ۾ صرف غير پولر امينو ايسڊ جي باقيات تي مشتمل ھوندو آھي، جنھن ۾ خالص چارج ھوندو آھي 20% کان گھٽ ڪل چارج امينو اسيد جي تسلسل جي، يا ھائيڊروفوبڪ moieties يا ڪيميائي گروپن تي مشتمل ھوندا آھن جيڪي transmembrane لاءِ ضروري ھوندا آھن.جيتوڻيڪ اهي سيلولر ٽرانسميبرن پيپٽائڊس اڪثر نظر انداز ڪيا ويندا آهن، اهي موجود آهن، جهڙوڪ فائبروبلاسٽ گروٿ فيڪٽر (K-FGF) ۽ فبروبلاسٽ گروٿ فيڪٽر 12 (F-GF12) کپوسي جي سارڪوما مان.


پوسٽ ٽائيم: مارچ-19-2023